Aniñón se halla a ciento un kilómetros de Zaragoza y a unos trece de Calatayud.
Se accede desde la carretera nacional (N-234) que lleva a Soria por Calatayud, y desde el desvío ya se puede ver cómo se alza la población sobre una colina arcillosa de la que emerge la iglesia parroquial.
Aniñón se halla situado a 729 m. de altitud en el piedemonte de la Sierra de la Virgen del Sistema Ibérico, cerca del curso del Ribota, un afluente del río Jalón. El valle se alza, ganando altura en esta población y dejando atrás la Sierra de Armantes, que se eleva frente al municipio.
Al fondo, el horizonte serrano, donde verdean los almendros y olivos, antes de perderse la vista en el pinar de la Sierra, donde surgen los dos arroyos que bajan abrazando la población: el Fresno y el Acuadrón, cuyos escasos caudales casi desaparecen en momentos de sequía. De ahí la necesidad de dos embalses, separados por la ermita que les da el nombre: Niño Jesús.